區別一、種類不同
翠云草和卷柏都是卷柏科卷柏屬多年生草本植物，但卻是不同的品種。為中型伏地蔓生蕨，主莖伏地蔓生，
區別二、根莖不同
翠云草為中型伏地蔓生蕨，主莖伏地蔓生，根托只生于主莖的下部或沿主莖斷續著生，根少分叉，被毛，莖圓柱狀，具溝槽，無毛，側枝5-8對，2回羽狀分枝。卷柏為土生或石生復蘇植物，呈墊狀，根托只生于莖的基部，根多分叉，密被毛，和莖及分枝密集形成樹狀主干，莖卵圓柱狀，不具溝槽，光滑，側枝2-5對，2-3回羽狀分枝。
區別三、葉子不同
翠云草的葉子邊緣全緣，主莖上的葉較分枝上的大，綠色，分枝上的腋葉寬橢圓形或心形。卷柏的葉子邊緣不為全緣，主莖上的葉較小枝上的略大，綠色或棕色，分枝上的腋葉卵形或橢圓形。
區別四、分布不同
翠云草分布于浙江、福建、臺灣、廣東漢密哈頓、廣西、湖南、貴州、云南、四川等省區，生于海拔40-1000m的山谷林下，多腐殖質土壤或溪邊陰濕雜草中，以及巖洞內，濕石上或石縫中。卷柏分布廣東、廣西、福建、浙江、江蘇、湖南、陜西，河北、山東、遼寧、吉林、黑龍江等地，多生于向陽的山坡巖石上，或干旱的巖石縫中，常見于石灰巖上，海拔（60-）500-1500（-2100）米。
區別五、功效不同
翠云草以全草入藥，鮮用或曬干，有清熱利濕、止血、止咳的功效，用于急性黃疸型傳染性肝炎、膽囊炎、腸炎、痢疾、腎炎水腫、泌尿系感染、風濕關節痛、肺結核咯血，外用治癤腫、燒燙傷、外傷出血、跌打損傷。卷柏以干燥全草入藥，具有活血通經的功效，用于經閉痛經、瘕瘕痞塊、跌撲損傷。
